Metilazione del DNA

Metilazione del DNA: che effetto abbiamo sull’attività del DNA?

Con lo sviluppo della scienza, abbiamo iniziato a concentrarci sempre di più sul materiale che costituisce tutti noi: il nostro DNA. Abbiamo imparato a conoscere la sua struttura, la sua formazione e molti altri aspetti che ci permettono di approfondire il campo della scienza chiamato genetica. Con il progredire della ricerca, abbiamo anche iniziato a esaminare il modo in cui alcuni fattori influenzano il nostro materiale genetico. Oggi ci concentreremo su uno di questi: la metilazione.

Cos’è la metilazione del DNA?

Possiamo caratterizzare la metilazione del DNA come un meccanismo di regolazione epigenetica che si verifica in tutti gli organismi eucarioti. Controlla l’espressione genica, attraverso cambiamenti nella struttura dei cromosomi, nella conformazione del DNA, nella stabilità del materiale genetico e nella funzione tra DNA e proteine. È un processo di post-replicazione che avviene nelle porzioni di citosina della sequenza dinucleotidica CpG. La metilazione delle isole CpG è un importante meccanismo per il silenziamento genico e l’inattivazione di specifici geni soppressori che compaiono nei tumori umani. Questo processo è essenziale per il normale sviluppo dell’organismo, ma si verificano anche disturbi che possono portare ad anomalie nello sviluppo embrionale o alla comparsa di tumori.

Quale reazione avviene durante la metilazione del DNA?

Se osserviamo il processo di metilazione del DNA da una prospettiva chimica, possiamo rilevare una semplice reazione chimica. La metilazione del DNA comporta l’attacco di gruppi alchilici (metilici) alle basi azotate dei nucleotidi. In particolare comprende la citosina e, meno comunemente, l’adenina. Il prodotto di reazione è solitamente 5-metilcitosina o N4-metilcitosina. La reazione è catalizzata dall’enzima DNA metilasi.

Metilazione del DNA
Metilazione del DNA

Cos’è l’epigenetica?

L’epigenetica è lo studio dell’influenza del comportamento e dei fattori ambientali sul funzionamento dei geni. I cambiamenti epigenetici sono reversibili e non modificano la sequenza del DNA, ma possono cambiare il modo in cui viene letta una determinata sequenza. La ricerca epigenetica si concentra sull’influenza dei seguenti fattori: età, sviluppo, infezione e gravidanza. I tipi di cambiamenti epigenetici nel genoma includono: metilazione del DNA, modificazione degli istoni e produzione di RNA non codificante.

Meccanismi epigenetici
La ilustración muestra una infografía que muestra el mecanismo epigenético.

In quali processi è coinvolta la metilazione del DNA?

  • Imprinting genomico
  • Sviluppo embrionale
  • Mantenere la stabilità cromosomica
  • Inattivazione del cromosoma X
  • Trascrizione
  • Replicazione dei cromosomi
  • Riparazione dei cromosomi
Metilazione CpG nello sviluppo del topo
El diagrama muestra el efecto de la metilación en el desarrollo embrionario del ratón.

Quali metodi possiamo usare per quantificare la metilazione globale del DNA?

Attualmente sul mercato da laboratorio possiamo trovare numerosi kit diversi per la determinazione quantitativa della metilazione del DNA. Un tipo comune di tali kit sono i kit di test ELISA. Permettono di eseguire rapidamente il test, che può essere completato dopo sole 2 ore. Possiamo trovare sul mercato diversi tipi di test di questo tipo, come i test colorimetrici o fluorimetrici. Spesso possiamo confrontare i risultati ottenuti con i risultati dei test ottenuti mediante analisi HPLC/MS. Permette il rilevamento della metilazione in tutti i tipi di organismi eucariotici.

ELISA TMB
La foto muestra una placa para realizar la prueba ELISA.